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研究室関連

PAICS
当研究室で開発・管理している量子化学計算プログラム「PAICS」のホームページです。
Paics View
量子化学計算プログラム「PAICS」の入力ファイル作成や結果の解析などを行うプログラムです。研究室で独自に開発されています。

 

ソフトウエア

AutoDock4
ドッキング計算ソフトウエアです。
AutoDock Vina
AutoDockの改良版のドッキング計算ソフトウエアです。
GAMESS
量子化学計算のソフトウエアです。
AMBER
分子動力学計算のソフトウエアです。
GROMACS
分子動力学計算のソフトウエアです。
MUSCLE
配列のマルチプルアライメントのソフトウエアです。
Modeller
ホモロジーモデリングのソフトウエアです。

 

データベース

PDB
タンパク質の立体構造データベースです。
PubChem
低分子化合物のデータベースです。
ZINC15
低分子化合物のデータベースです。
HMDB
ヒトの代謝物のデータベースです。
EMSL
量子化学計算で使用する基底関数のデータベースです。
SKEMPI v2.0
アミノ酸変異に対するタンパク間相互作用の変化と構造のデータベースです。

 

その他

研究公正ポータル
JSTの研究倫理教育に関するサイトです。当研究室における研究倫理教育に使用しています。
研究公正(JSPS)
JSPSの研究倫理教育に関するサイトです。当研究室における研究倫理教育に使用しています。
研究公正(AMED)
AMEDの研究倫理教育に関するサイトです。当研究室における研究倫理教育に使用しています。

 

関連学会など

CBI学会
日本薬学会
日本化学会
日本生物物理学会
FMODD